清华资本运营总裁班课程着眼于全球视角，以课程的实用性为向导，通过实地调研，时刻关注中国企业的现状、动态与需求，经知名教授设计整套课程方案，并与资深教授反复研讨和修订，最后以课程的严谨性、逻辑性和实践性为基本准则进行严格的试讲和评估程序才得以推出。课程推出后，严格履行课程的更新与二次开发，不断创新并坚持将最前沿的管理知识与最具代表性的案例呈现于课堂。
清华资本运营总裁班课程体系分为六大模块十六个研究方向，旨在巩固企业领袖的基础管理知识，提升核心管理能力，加强企业在大环境下的战略与决策能力。

开学导向模块旨在开发心智，磨炼意志，激发潜能，陶冶情操，增进团队合作意识;

基础理论课程模块立足于经典管理知识体系梳理、战略思维培养、领导力开发实践和企业成长管理，从宏观经济分析到微观环境把握，汇集了国际最前沿的管理学理论与方法，体现前沿性、针对性、实用性，为学员夯实管理学理论基础;

管理职能课程模块以决策者高度，从创新思维、管理执行、企业实践三大方面系统完整地解决企业管理实务，为企业转型升级保驾护航。定期举行高端主题沙龙、企业论坛活动，邀请海内外知名专家学者，举办专题讲座，紧密结合中国管理实际，深入阐述世界经济发展前言理论;

特色学科课程模块依托清华医学、材料科学与工程、机械工程、矿业工程、管理科学与工程、交通运输、土木工程、有色金属冶金与金融等特色明显的优势学科，“管理知识+学科领域知识”满足个性化需求的矩阵式人才培养模式的创新性举措，以学科间的交叉与融合，激发新灵感，开拓新领域，引领行业可持续发展;

海外游学、国内游学课程模块让资本运营总裁班学员的视野得以开拓，素质得以提升，国际敏感度得以加强，并通过观摩、交流与学习的方式开拓视野、知行合一，拓宽国际交流平台，碰撞思维，共研商道;

◆ 核心课程：管理经济学、人力资源管理、公司财务管理、公司治理、营销管理、组织行为学、战略管理、商业伦理与企业社会责任、社会主义理论与实践、商务英语与沟通

◆ 选修课程：运营管理、创新创业与企业家精神、创业与中小企业管理、国际金融、证券与期货、企业融资与资本运营、国际比较管理、项目管理、国学与管理、税收筹划、投资项目评估、管理信息系统、经济法、国际贸易、循环经济与环境经营管理、两型社会与生态文明、宏观经济分析与政策解读、基金理论与实务、经济运行与中国资本市场、互联网金融、金融法律、并购与重组、大数据与商业模式创新、行为金融学、财务报表分析、投资策略和风险管理、私募股权管理与风险投资等。